Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx2P81066 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx2P81066 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms