Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3eP70275 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema3eP70275 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3eP70275 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3eP70275 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms