Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SnrpnP63163 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SnrpnP63163 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SnrpnP63163 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms