Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtnP63089 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtnP63089 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtnP63089 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtnP63089 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtnP63089 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtnP63089 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtnP63089 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtnP63089 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtnP63089 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtnP63089 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtnP63089 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtnP63089 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtnP63089 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtnP63089 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtnP63089 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtnP63089 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtnP63089 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtnP63089 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtnP63089 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtnP63089 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtnP63089 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtnP63089 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtnP63089 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtnP63089 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms