Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tspan5P62080 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan5P62080 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms