Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psme3P61290 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psme3P61290 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psme3P61290 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms