Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Taf13P61216 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf13P61216 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf13P61216 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf13P61216 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms