Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Romo1P60603 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Romo1P60603 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms