Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b6P59708 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b6P59708 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms