Protein–RNA interactions for Protein: P58355

Slc45a2, Membrane-associated transporter protein, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a2P58355 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc45a2P58355 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc45a2P58355 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms