Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dpf3P58269 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dpf3P58269 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms