Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Aqp4P55088 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aqp4P55088 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aqp4P55088 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms