Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccr4P51680 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccr4P51680 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr4P51680 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr4P51680 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr4P51680 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr4P51680 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr4P51680 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccr4P51680 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms