Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp3P49194 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbp3P49194 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbp3P49194 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms