Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gbx2P48031 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms