Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pax7P47239 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pax7P47239 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax7P47239 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pax7P47239 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pax7P47239 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax7P47239 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax7P47239 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax7P47239 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax7P47239 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax7P47239 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax7P47239 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms