Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpl28P41105 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl28P41105 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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