Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprkP35822 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprkP35822 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprkP35822 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprkP35822 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprkP35822 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprkP35822 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprkP35822 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PtprkP35822 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprkP35822 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprkP35822 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprkP35822 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprkP35822 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms