Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tfap2aP34056 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tfap2aP34056 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms