Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pola1P33609 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pola1P33609 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pola1P33609 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pola1P33609 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pola1P33609 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pola1P33609 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pola1P33609 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Pola1P33609 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pola1P33609 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pola1P33609 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pola1P33609 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pola1P33609 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pola1P33609 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pola1P33609 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Pola1P33609 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pola1P33609 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pola1P33609 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pola1P33609 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pola1P33609 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pola1P33609 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pola1P33609 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pola1P33609 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pola1P33609 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pola1P33609 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pola1P33609 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pola1P33609 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pola1P33609 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pola1P33609 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pola1P33609 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pola1P33609 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pola1P33609 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Pola1P33609 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pola1P33609 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Pola1P33609 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms