Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SsbP32067 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SsbP32067 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SsbP32067 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SsbP32067 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SsbP32067 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SsbP32067 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SsbP32067 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SsbP32067 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SsbP32067 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SsbP32067 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SsbP32067 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SsbP32067 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SsbP32067 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SsbP32067 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SsbP32067 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SsbP32067 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SsbP32067 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SsbP32067 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SsbP32067 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SsbP32067 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SsbP32067 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SsbP32067 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SsbP32067 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SsbP32067 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SsbP32067 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SsbP32067 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SsbP32067 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SsbP32067 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SsbP32067 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SsbP32067 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SsbP32067 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SsbP32067 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SsbP32067 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SsbP32067 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SsbP32067 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SsbP32067 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SsbP32067 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SsbP32067 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SsbP32067 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SsbP32067 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SsbP32067 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SsbP32067 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SsbP32067 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SsbP32067 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms