Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd9P28357 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd9P28357 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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