Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtsgP28293 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtsgP28293 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtsgP28293 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtsgP28293 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CtsgP28293 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtsgP28293 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtsgP28293 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtsgP28293 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CtsgP28293 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtsgP28293 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CtsgP28293 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtsgP28293 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtsgP28293 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtsgP28293 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsgP28293 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsgP28293 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtsgP28293 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtsgP28293 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CtsgP28293 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsgP28293 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsgP28293 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsgP28293 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsgP28293 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsgP28293 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CtsgP28293 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CtsgP28293 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CtsgP28293 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms