Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Edn1P22387 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn1P22387 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn1P22387 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms