Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cst3P21460 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cst3P21460 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cst3P21460 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cst3P21460 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cst3P21460 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cst3P21460 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cst3P21460 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms