Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefhP19246 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefhP19246 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefhP19246 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefhP19246 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NefhP19246 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NefhP19246 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NefhP19246 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NefhP19246 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NefhP19246 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NefhP19246 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NefhP19246 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NefhP19246 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefhP19246 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NefhP19246 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefhP19246 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefhP19246 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefhP19246 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NefhP19246 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NefhP19246 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NefhP19246 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NefhP19246 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefhP19246 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefhP19246 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefhP19246 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefhP19246 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefhP19246 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NefhP19246 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefhP19246 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NefhP19246 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms