Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Csn1s1P19228 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Csn1s1P19228 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms