Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RargP18911 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RargP18911 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RargP18911 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RargP18911 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RargP18911 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RargP18911 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RargP18911 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RargP18911 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RargP18911 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RargP18911 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RargP18911 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RargP18911 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RargP18911 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RargP18911 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RargP18911 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RargP18911 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RargP18911 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RargP18911 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RargP18911 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RargP18911 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RargP18911 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RargP18911 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RargP18911 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RargP18911 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RargP18911 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RargP18911 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RargP18911 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RargP18911 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RargP18911 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RargP18911 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RargP18911 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RargP18911 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RargP18911 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RargP18911 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RargP18911 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RargP18911 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RargP18911 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RargP18911 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RargP18911 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RargP18911 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RargP18911 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RargP18911 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RargP18911 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RargP18911 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RargP18911 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RargP18911 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RargP18911 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RargP18911 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.5 ms