Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdc1P18828 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms