Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P18530 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P18530 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P18530 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P18530 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P18530 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P18530 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18530 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18530 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18530 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18530 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18530 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18530 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18530 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18530 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18530 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18530 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18530 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18530 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18530 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms