Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZKSCAN1P17029 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZKSCAN1P17029 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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