Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim30aP15533 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30aP15533 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms