Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxa9P09631 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxa9P09631 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms