Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc8P09025 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc8P09025 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms