Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hoxb7P09024 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb7P09024 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxb7P09024 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms