Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa5P09021 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxa5P09021 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms