Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeflP08551 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeflP08551 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeflP08551 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeflP08551 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeflP08551 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeflP08551 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeflP08551 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NeflP08551 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NeflP08551 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NeflP08551 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NeflP08551 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NeflP08551 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NeflP08551 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NeflP08551 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NeflP08551 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NeflP08551 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NeflP08551 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NeflP08551 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NeflP08551 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NeflP08551 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NeflP08551 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NeflP08551 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NeflP08551 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NeflP08551 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NeflP08551 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NeflP08551 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NeflP08551 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NeflP08551 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NeflP08551 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NeflP08551 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NeflP08551 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeflP08551 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeflP08551 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeflP08551 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeflP08551 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeflP08551 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeflP08551 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeflP08551 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NeflP08551 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NeflP08551 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NeflP08551 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NeflP08551 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NeflP08551 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NeflP08551 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NeflP08551 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NeflP08551 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NeflP08551 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NeflP08551 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NeflP08551 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeflP08551 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeflP08551 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeflP08551 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeflP08551 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeflP08551 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NeflP08551 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NeflP08551 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NeflP08551 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NeflP08551 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NeflP08551 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NeflP08551 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NeflP08551 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NeflP08551 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NeflP08551 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NeflP08551 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms