Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgamP05555 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgamP05555 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgamP05555 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ItgamP05555 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ItgamP05555 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms