Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01727 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01727 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01727 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01727 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01727 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01727 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01727 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01727 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms