Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnb1P01575 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ifnb1P01575 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms