Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setdb1O88974 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setdb1O88974 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setdb1O88974 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms