Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctnnal1O88327 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnal1O88327 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctnnal1O88327 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnal1O88327 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms