Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nptx2O70340 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nptx2O70340 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms