Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gfi1bO70237 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfi1bO70237 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms