Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmx1O70218 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmx1O70218 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms