Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd200O54901 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd200O54901 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd200O54901 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms