Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BUD23O43709 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BUD23O43709 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BUD23O43709 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BUD23O43709 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BUD23O43709 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BUD23O43709 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BUD23O43709 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BUD23O43709 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BUD23O43709 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BUD23O43709 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BUD23O43709 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BUD23O43709 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BUD23O43709 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BUD23O43709 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BUD23O43709 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BUD23O43709 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BUD23O43709 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BUD23O43709 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BUD23O43709 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BUD23O43709 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BUD23O43709 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BUD23O43709 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BUD23O43709 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BUD23O43709 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BUD23O43709 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BUD23O43709 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BUD23O43709 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BUD23O43709 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms