Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bnc1O35914 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bnc1O35914 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnc1O35914 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms