Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lsm2O35900 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm2O35900 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms