Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb3O35393 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms